鸡蛋在孵化初期，需要的氧气很少。胚胎每小时消耗氧气量，从孵化初期的0.51立方厘米增加到第十七天的17.34立方厘米。在整个孵化期间的氧气消耗总量约4 000～4 500立方厘米，排出的二氧化碳约3 000～5 000立方厘米，鸡胚自发的呼吸运动开始于孵化第十四天，这对胚胎吞食混有蛋白的羊水起了很大作用。

孵化第十六天，呼吸次数增加到4次／分，第十七天增加到8次／分，第十八天为25～50次／分，而有规律地呼吸是在小鸡啄破蛋壳之后，即第二十天中期的呼吸次数50～55次／分。可见孵化期间，特别在孵化后期，通风换气的重要性。

一般要求在孵化机内应经常保持有足够量的氧气，含量不能低于20%，二氧化碳的含量保持在0.3～0.6%，不能超过1%。二氧化碳量多时会产生畸形，体弱，孵化率降低。从解剖死胎测定其气室内的气体含量，发现有50%的死胎蛋，气室内二氧化碳量远远超过3%，而氧气的含量却低于10%。